Produção Técnico-Científica da Coordenação de Pós-graduação e Aperfeiçoamento - COPGA em 2019


PRODUÇÃO CIENTÍFICA



PUBLICAÇÕES CIENTÍFICAS

Artigos Publicados em Revistas com Corpo Editorial:

Martins, M. B., Vasconcellos, R. T. B. E., Esquef, P. A. A.; 'Models for Synchrophasor with Step Discontinuities in Magnitude and Phase: Estimation and Performance'; DOI: 10.1109/TIM.2019.2893716; IEEE Transactions on Instrumentation and Measurement; Vol: 68; No: 6; Pág: 2007 - 2014; 2019; Disponível em: https://ieeexplore.ieee.org/document/8637021

Total de Artigos Publicados em Revistas com Corpo Editorial: 1


ATIVIDADES CIENTÍFICAS

Desenvolvimento de Softwares:

Gomes, A. T. A., Valentin, F., Concha, D. F. P., Pereira, W. S.; 'MHM Solver: simulador de elementos finitos multiescala'; Linux; Simulador de elementos finitos multiescala baseado no método MHM; HPC; Data Início: 04/02/2014

Schulze, B.R., Fernandes, F. J., Mury, A. R.; 'Neblina'; LINUX; Espacos Virtuais de Trabalho para uso em Aplicacoes Cientıficas; Data Início: 01/01/2011

Giraldi, G. A. , Leite, D. A. T. Q., Lira, M. H. P., de Aquino, L. C. M.; 'PyImageVis'; Data Início: 01/01/2010

Giraldi, G. A. , da Costa, L. C.; 'HPP 3D'; Windows/Linux; Estudo de modelo baseado em autômatos celulares para simulação de fluidos; NetLogo; Data Início: 01/01/2007

Giraldi, G. A. ; 'VisFluidAnimator'; PC; Animação de fluidos; Windows; Data Início: 01/10/2007

de Vasconcelos, A. T. R. , da Silva, R. C., Egas, G. A. V., Calfo, V. A.; 'Brazilian Microbiological Resource Center'; UNIX/Apache/MYSQL; Pesquisa e desenvolvimento de informações para Bioinformática; Todos; Data Início: 01/04/2006

de Vasconcelos, A. T. R. , de Almeida, L.G.P., Mundstein, A. S., Calfo, V. A.; 'CTPedia'; UNIX/Apache/MYSQL; Pesquisa e desenvolvimento de informações para Bioinformática; Todos; Data Início: 01/04/2006

de Vasconcelos, A. T. R. , da Silva, R. C., Calfo, V. A.; 'Eletronic Online Taxonomy of Prokaryotes'; UNIX/Apache/MYSQL; Pesquisa e desenvolvimento de informações para Bioinformática; Todos; Data Início: 01/11/2006

de Vasconcelos, A. T. R. , Egas, G. A. V., Calfo, V. A.; 'Hemophilia Brazil Project'; UNIX/Apache/MYSQL; Pesquisa e desenvolvimento de informações para Bioinformática; Todos; Data Início: 02/01/2006

de Vasconcelos, A. T. R. , da Silva, R. C., Calfo, V. A., Egas, G. A. V.; ' /M. hyopneumoniae/ Expression Project'; UNIX/Apache/MYSQL; Pesquisa e desenvolvimento de informações para Bioinformática; Todos; Data Início: 01/08/2006

Giraldi, G. A. ; 'FluidSurfaceAnimator'; PC; Animação de fluxo superficial; Windows; Data Início: 01/01/2006

Giraldi, G. A. , da Costa, L. C.; 'HPP 2D'; Windows/Linux; Estudo de modelo de simulação de fluidos baseado em patículas; NetLogo; Data Início: 01/01/2006

de Vasconcelos, A. T. R. , de Almeida, L.G.P., Souza, R. C. ; 'Tractor'; UNIX/Apache/MYSQL; Pesquisa e desenvolvimento de informações para Bioinformática; Todos; Data Início: 01/06/2004

de Vasconcelos, A. T. R. , Souza, R. C. ; 'MamMiBase'; UNIX/Apache/MYSQL; Pesquisa e desenvolvimento de informações para Bioinformática; Todos; Data Início: 01/11/2003

de Vasconcelos, A. T. R. , de Almeida, L.G.P., Souza, R. C. , Paixão, R.F.C., Meirelles, D. B., da Silva, R. C., Cunha, O L.; 'SABIA System for Automated Bacterial Integrated Annotat'; UNIX/Apache/MYSQL; Anotação de genomas; Todos; Data Início: 02/01/2001

Total de Desenvolvimento de Softwares: 15


Outras Atividades:

Ziviani, A.; ; Tipo Atividade: Membro de Comitê'Membro do Comitê Técnico em Monitoramento de Redes (CT-Mon) da RNP'; 15/04/2011

Giraldi, G. A. ; ; Tipo Atividade: Elaboração de Projeto para Edital Universal, CNPq, 2009'Projeto de Pesquisa: Registro, Segmentação e Classificação de Imagens de Tomografias e Raio-X da Região Maxilo-Facial'; 01/06/2007

Apolinario Jr., A. L., Giraldi, G. A. , Silva, R.L.S.; ; Tipo Atividade: Elaboração de projeto para o Edital Universal, CNPq, 2009'Projeto de Pesquisa: Aplicações de Realidade Aumentada para Bioengenharia Craniofacial'; 01/01/2006

de Oliveira, J. C.; ; Tipo Atividade: Elaboração de Projeto'ACAmPE - Ambiente Colaborativo para a Área de Petróleo'; 01/08/2005

de Oliveira, J. C.; ; Tipo Atividade: Elaboração de Projeto'ACOMETE - Ambientes COlaborativos para Medicina e TrEinamento'; 01/08/2005

de Oliveira, J. C.; ; Tipo Atividade: Elaboração de Projeto'Ambientes Virtuais Colaborativos Massivos'; 01/12/2004

Total de Outras Atividades: 6


ORIENTAÇÕES

Teses de Doutorado em Andamento:

Orientador(es): Silva, R. S. ; Orientado: Anderson Fernandes Pereira dos Santos; 'Desenvolvimento de Modelos de Desempemho Algebricos para Aplicacoes de Dinamica dos Fluidos Computacionais'; Data Início: 01/01/2003

Orientador(es): Corrêa, G. O. ; Orientado: Loreci Zanardini; 'Problemas de Controle Robusto em canais de Irrigação'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 05/03/2002

Orientador(es): Galeão, A. C. N. R. ; Orientado: Flávio Pietrobon Costa; 'Acoplamento de Escoamentos em rede Superficial e Subsuperficial'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2004

Orientador(es): Toledo, E. M. ; Orientado: Luciana Santos da Silva; 'Estudo de modelos para simulção de escoamentos com fronteira livre'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2006

Orientador(es): Tanajura, C.A.S.; Orientado: Jean Felix de Oliveira; 'Um Método de Assimilação de Dados para Previsão oceanográfica ao Largo da Costa Sudeste do Brasil, utilizando o Modelo Oceânico HYCOM'; Data Início: 01/03/2004

Orientador(es): Silva, R. S. ; Orientado: Eduardo Henrique da Rocha Coppoli; 'O Método de Elementos Finitos Aplicado ao Eletromagnetismo e Considerações e Motivações do Uso de um Método Sem Malha (Meshless) para Problemas desta Natureza'; Data Início: 01/03/2004

Orientador(es): Tanajura, C.A.S., Dias, P. L. S., Goncalves, L. G.; Orientado: Claudia Adam Ramos; 'Desenvolvimento de Métodos de Assimilação de Dados de Umidade do Solo e Aplicações em Modelos Acoplados Atmosfera-Biosfera sobre o Semi-Árido do Nordeste do Brasil'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 03/04/2007

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. ; Orientado: Fabíola Marques de Carvalho; 'Comparação genômica entre bactérias simbióticas diazotróficas e bactérias patogênicas relacionadas filogeneticamente'; Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/08/2006

Orientador(es): Toledo, E. M. ; Orientado: Paulo César Ferreira; 'Análise mecânica não linear de tecidos cardiácos'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2008

Orientador(es): Bevilacqua, L. , Galeão, A. C. N. R. ; Orientado: Simone de Almeida Delphim; 'Modelos Bio-Econômicos de Invasão Biológica'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 28/03/2007

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: Adílson Vicente Xavier; 'Desenvolvimento de Operadores de Movimento Local para Algoritmos Genéticos Aplicados à Predição ab initio de Estruturas de Proteínas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/01/2008

Orientador(es): Porto, F.A.M., de Macedo, J. A. F.; Orientado: Vinicius Pires de Moura Freire; 'Gerência de Grandes dados Ligados'; Universidade Federal do Ceará, UFC, Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2011

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. ; Orientado: Cecília Coimbra Klein; 'Estudo Bioinformático do diálogo metabólico entre um tripanosomatídeo não patogênico e seu endosimbionte com objetivos evolutivos e funcionais'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Université Claude Bernard - Lyon I; Data Início: 01/08/2010

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. ; Orientado: Daiane Cristina Cabral Ferreira; 'Transcriptoma usando sequenciamento em larga escala em células epiteliais tímicas após silenciamento do gene CD49f e ensaios funcionais'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Universidade Federal do Rio de Janeiro - Instituto de Biologia; Data Início: 01/03/2008

Orientador(es): Blanco, P. J., Feijóo, R. A.; Orientado: Rocha, F. F.; 'Modelagem Multiescala de Mecanismos de Falha em Tecidos Biológicos'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2015

Orientador(es): Giraldi, G. A. ; Orientado: Filisbino, T. A.; 'MULTI-CLASS DISCRIMINANT ANALYSIS BASED ON ENSEMBLES FOR RANKING PRINCIPAL COMPONENTS'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Centro Universitário da FEI ; Data Início: 01/03/2015

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: Werdt, P. R. T.; 'Algoritmos Evolutivos Paralelos para Predição de Estruturas de Proteínas.'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 05/05/2014

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: dos Santos, K. B.; 'Docking Proteina-Proteina.'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 04/08/2014

Orientador(es): Gomes, A. T. A., Valentin, F.; Orientado: Zillmer, F.; 'Implementação e paralelização de métodos de elementos finitos multiescala: aplicações no sistema cardiovascular humano (Título Provisório)'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/02/2014

Orientador(es): Valentin, F., Gomes, A. T. A.; Orientado: Pereira, W. S.; 'Metodos de Elementos Finitios Multi-Escalas para Problemas de Ondas Elásticas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/02/2015

Orientador(es): Barreto, A.M.S., Ziviani, A.; Orientado: de Mendonça, M. R. F.; 'Aprendizagem de Máquina e Redes Complexas (título provisório)'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 23/09/2016

Total de Teses de Doutorado em Andamento: 21


Dissertações de Mestrado Concluídas:

Orientador(es): Ziviani, A., Esquef, P. A. A., Vieira, A. B.; Orientado: Carnivali, G. S.; 'Um Método para Acelerar a Detecção de Comunidades em Redes Complexas Esparsas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 13/03/2019

Total de Dissertações de Mestrado Concluídas: 1


Dissertações de Mestrado em Andamento:

Orientador(es): Raupp, F. M. P. ; Orientado: Cristiane Dias; 'Otimização linear'; Data Início: 01/01/2004

Orientador(es): Borges, C. C. H. , Ebecken, N. F. F.; Orientado: André Mello; 'Uma estratégia de filtragem Aplicada na Seleção de Características em Problemas de Classificação'; COPPE-UFRJ-Programa de Engenharia Civil, PEC-COPPE; Data Início: 01/07/2006

Orientador(es): Garcia, E. L. M. ; Orientado: Patricia Costa; 'Programacao Multithreading para Computação de Alto Desempemnho de Programas de Elementos Finitos'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2006

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. , Thompson, F.; Orientado: Ana Cristina Gomes Silveira; 'Desenvolvimento de Uma Ferramenta para a Predição de Small RNAs em Vibrio'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Universidade Federal do Rio de Janeiro - Instituto de Biologia; Data Início: 11/03/2008

Orientador(es): Borges, C. C. H. , da Silva, J. C. P.; Orientado: Maria Fernanda Barbosa Wanderley; ' Algoritmos Genéticos no Problema de Regulação Gênica '; Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ; Data Início: 01/08/2007

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: Luíz Zacarias do Amaral; 'Utilização de Técnicas de Reconhecimentos de Padrões para a Previsão de Constantes de Inibição Recptor-Ligante'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2009

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. ; Orientado: Godinho, C. P. S.; 'Pequenos RNAs em mycoplasmas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2012

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. ; Orientado: Ribeiro, M. I.; 'Classificação baseada em composição de reads metagenômicos por meio de máquinas de vetores de suporte'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 01/03/2011

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: Pereira, F. S. S.; 'Funções empíricas de afinidade proteína-ligante para triagem virtual em larga escala.'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; Data Início: 09/03/2015

Total de Dissertações de Mestrado em Andamento: 9


Trabalhos de Conclusão de Curso de Graduação:

Orientador(es): Giraldi, G. A. , Silva, R.L.S.; Orientado: João Vicente Reis; 'Animação de Fluidos usando SPH e Rendering Baseado em Modelos Físicos'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Universidade Estácio de Sá - Petrópolis, RJ; 09/06/2009

Orientador(es): Giraldi, G. A. ; Orientado: Victor Vescovini; 'Representacao Tensorial para Imagens Digitais, Reducao de Dimensinalidade e Reconstrucao'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Instituto Superior de Tecnologia em Ciência da Computação de Petrópolis, ISTCC-P; 01/08/2008

Orientador(es): Giraldi, G. A. ; Orientado: Diego Leite; 'Segmentação e Visualização de imagens Radiológicas em Odontologia'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Instituto Superior de Tecnologia em Ciência da Computação de Petrópolis, ISTCC-P; 01/08/2008

Total de Trabalhos de Conclusão de Curso de Graduação: 3


Iniciação Científica:

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. , Thompson, C. E.; Orientado: Artur Duque Rossi; 'Aspectos evolutivos e estruturais de proteínas de bactérias patogênicas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Universidade Católica de Petrópolis, UCP; 01/03/2011

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. , Thompson, C. E.; Orientado: Rafael Nicolay Baptista da Silva; 'Evolução molecular de proteínas bacterianas'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Universidade Católica de Petrópolis, UCP; 01/03/2011

Orientador(es): de Oliveira, J. C., dos Santos, S. R.; Orientado: Rivaldo Rodrigues Machado Junior; 'Controle Dinâmico de Camera em Ambientes Virtuais de Mesa para Ampliar Imersão'; Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/08/2008

Orientador(es): Almeida, R. C. ; Orientado: Rodolfo Honorato de Mello Luz; 'Métodos Numéricos'; 01/08/2007

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: Karina Batista; 'CONSTRUÇÃO DE BIBLIOTECAS DE FRAGMENTOS PARA A PREDIÇÃO DE ESTRUTURAS DE PROTEÍNAS'; 01/08/2007

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: Damásio Antônio Alves Ferreira; 'Desenvolvimento do Portal MHOLline: Sistema Computacional para Modelagem Comparativa em Genômica Estrutural'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/09/2006

Orientador(es): Kritz, M. V. , Trindade dos Santos, M., Rodrigues, P.S.S.; Orientado: Liliane Paiva de Souza; 'Implementação de uma Estrutura de Dados para Grafos Todo-parte'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 18/08/2006

Orientador(es): de Vasconcelos, A. T. R. , da Silva, J. C. P.; Orientado: Glauber Marcius Cardoso Menezes; 'Aplicalção de Linguagens Formais ao Problema de Regulação Gênica'; Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/03/2005

Orientador(es): Kritz, M. V. ; Orientado: Simone de Almeida Pinto; 'Especificação de um modelo epidemiológico em UML'; 01/03/2004

Total de Iniciação Científica: 9


Orientação ao Pós Doutorado:

Orientador(es): Fragoso, M. D. , Todorov, M. G.; Orientado: Jose Cristiano Pereira; 'Análise Probabilística de Risco em Motores de Aeronave'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, GE Aviation, GE Aviation; 01/06/2015

Orientador(es): Schulze, B.R.; Orientado: Antonio Roberto Mury; 'Escalonamento de Recursos em Ambientes Virtuais de Trabalho Nuvens e Grades Computacionais'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/05/2011

Orientador(es): Dardenne, L. E. ; Orientado: Camila Silva de Magalhães; 'Desenho Racional de Novos Inibidores de Aspartil Proteases para o Tratamento da Malária: Desenvolvimento de Metodologias de “Docking” e Aplicações '; Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/10/2009

Orientador(es): Giraldi, G. A. ; Orientado: Julio Santiago Espinoza Ortiz; 'Modelagem de Tecidos Humanos via Modelos Computacionais Baseados em Métodos da Física Matemática'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/11/2005

Total de Orientação ao Pós Doutorado: 4


Bolsistas em Projetos de Pesquisa:

Orientador(es): de Oliveira, J. C.; Orientado: Daniel Ribeiro Chelles; 'Modelagem Geométrica de Objetos 3D'; Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC; 01/12/2006

Total de Bolsistas em Projetos de Pesquisa: 1



PRODUÇÃO TÉCNICA

ATIVIDADES TÉCNICAS

Outras Atividades Técnicas:

Fragoso, M. D. ; 'AssessorTécnico da FAPESP'; 01/07/2009

Total de Outras Atividades Técnicas: 1


DESENVOLVIMENTO DE SOFTWARES E SISTEMAS COMPUTACIONAIS

Softwares:

Murad, M. A. , Garcia, E. L. M. , Pereira, P. A., Lopes, T. V.; 'Multiscale Shale Gas Simulator - MSShaleGaS'; Data: 09/12/2016

Dardenne, L. E. , Guedes, I. A., da Silva, E. K., de Magalhães, C. S., Almeida, D. M., Barbosa, H. J. C.; 'Portal web DockThor'; www.dockthor.lncc.br; Data: 01/06/2013

Giraldi, G. A. , Leite, D. A. T. Q., Lira, M. H. P., de Aquino, L. C. M.; 'PyImageVis.'; Data: 01/01/2010

Dardenne, L. E. , Custodio, F. L., Linden, M. G. V. D., Barbosa, H. J. C.; 'GAPF NMR - Genetic Algorithm for Protein Folding using RMN restraints'; Linux - C++; Programa para predição de eestruturas 3D de proteínas utilizndo dados experimentais de RMN; Linux; Data: 01/03/2007

Feijóo, R. A., Blanco, P. J.; 'HeMoLab 1.0 Beta'; Linux, Windows; Modelagem e Simulação Computacional do Sistema Cardiovascular Humano; Data: 01/01/2006

Furtado, C. B., Goliatt, P. V. Z. C., Dardenne, L. E. ; 'LLDB - LASSBio Ligand Data Bank'; LINUX; Gerenciar o Banco de ligantes do LASSBio/Fac. Farmácia/UFRJ; WEB Restrito; Data: 01/01/2005

Total de Softwares: 6